Врачи создали новый метод диагностики рака, который основан на анализе активности генов в клетках крови с помощью искусственного интеллекта.

Его эффективность подтвердили исследователи из Немецкого центра нейродегенеративных заболеваний (DZNE) и Университета Бонна в своей новой работе.

Их подход основан на анализе генной активности клеток, обнаруженных в крови. Используемый на практике этот подход может поддерживать традиционную диагностику и, возможно, ускорить начало терапии.

– Мы стремились исследовать потенциал ИИ на основе конкретного примера. Поскольку для этого требуются большие объемы данных, мы оценили данные о генной активности клеток крови. Многочисленные исследования были проведены по этой теме, и результаты доступны через базы данных. Таким образом, существует огромный пул данных. Мы собрали практически все, что в настоящее время доступно, — объясняет профессор Йоахим Шульце, руководитель исследовательской группы в DZNE и руководитель отдела геномики и иммунорегуляции в Институте LIMES Университета Бонна.

Шульце и его коллеги сосредоточились на «транскриптоме», который является своего рода отпечатком активности гена. В каждой клетке, в зависимости от ее состояния, фактически «включаются» только определенные гены, что отражается в их профилях активности генов. Именно такие данные — полученные из клеток в образцах крови и охватывающие многие тысячи генов — были проанализированы в текущем исследовании.

– Транскриптом содержит важную информацию о состоянии клеток. Однако классическая диагностика основана на различных данных. Поэтому мы хотели выяснить, чего может достичь анализ транскриптома с помощью искусственного интеллекта, то есть обучаемых алгоритмов, — сказал Шульце.

Чтобы разработать прообраз теста для диагностики острого миелоидного лейкоза (ОМЛ), ученые проанализировали более 12 тысяч образов крови взрослых и детей из 105 различных исследований. Определить специфичные паттерны активности генов удалось благодаря анализу большого количества образцов крови от здоровых людей и пациентов с ОМЛ.

Классическая диагностика ОМЛ включает множество этапов и для окончательной постановки диагноза необходима пункции костного мозга. Новый анализ крови может стать альтернативой этой инвазивной процедуре, однако авторы пока осторожно называют метод только вспомогательным.

– В принципе, крови, взятой семейным врачом и отправленной в лабораторию для анализа, может быть достаточно. Я предполагаю, что стоимость будет меньше 50 евро. Однако мы еще не разработали работоспособный тест. Мы только показали, что подход работает в принципе, — признал Шульце.

Напомним, что в США начали тестировать вакцину против рака.